Обычно по размеру кофейные ягоды напоминают мелкие виноградины, но в отличие от последних большую их часть занимают семена. Они заключены в несколько слоев, выполняющих различные функции. Собственно, именно во время переработки происходит их очистка без нарушения целостности самих зёрен.